Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Itga4Q00651 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms