Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smn1P97801 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smn1P97801 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Smn1P97801 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smn1P97801 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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