Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arf1P84078 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arf1P84078 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arf1P84078 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Arf1P84078 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Arf1P84078 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 648.2 ms