Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptprn2P80560 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ptprn2P80560 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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