Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb13P70321 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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