Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chl1P70232 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms