Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vsnl1P62761 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms