Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms