Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps33bP59016 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms