Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf5P56477 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms