Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab4aP56371 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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