Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ClgnP52194 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms