Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TspoP50637 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms