Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms