Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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CitP49025 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CitP49025 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CitP49025 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CitP49025 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CitP49025 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CitP49025 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CitP49025 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CitP49025 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms