Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms