Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
GdnfP48540 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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GdnfP48540 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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GdnfP48540 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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GdnfP48540 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
GdnfP48540 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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