Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VdrP48281 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VdrP48281 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VdrP48281 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms