Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ItgavP43406 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ItgavP43406 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms