Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms