Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mmp9P41245 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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