Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ThpoP40226 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms