Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PpardP35396 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms