Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Hoxc5P32043 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxc5P32043 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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