Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms