Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VtnP29788 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms