Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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