Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd10P28359 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms