Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms