Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms