Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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