Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms