Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcnaP17918 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PcnaP17918 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms