Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gabra6P16305 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms