Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms