Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms