Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Becn2P0DM65 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms