Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb1P09055 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Itgb1P09055 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itgb1P09055 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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