Protein–RNA interactions for Protein: P04941

Ig kappa chain V-VI region NQ2-48.2.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04941 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04941 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04941 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04941 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P04941 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04941 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms