Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-Eb1P04230 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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H2-Eb1P04230 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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