Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BlmO88700 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BlmO88700 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BlmO88700 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BlmO88700 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BlmO88700 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms