Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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