Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FiglaO55208 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms