Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Clk2O35491 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Clk2O35491 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Clk2O35491 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clk2O35491 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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