Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Degs1O09005 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms