Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tcof1O08784 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tcof1O08784 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tcof1O08784 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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