Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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MttpO08601 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MttpO08601 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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MttpO08601 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MttpO08601 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms