Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3239L7N2D9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3239L7N2D9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms