Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms