Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms